本实用新型属于食品杀菌技术领域，具体涉及一种微波杀菌装置，包括杀菌箱和输送台，其中，所述杀菌箱设置在输送台的顶部，所述杀菌箱的内部设有用于杀菌的微波发生器，所述输送台顶部设有用于输送待杀菌物品的输送带，所述输送带平行设置在微波发生器的下方，所述输送台的两端分别设有上料层和下料层，且上料层和下料层上分别设有输送带，其目的在于，通过连接板的设置，使得在杀菌过程中能够使干果在杀菌箱内均匀翻滚，从而确保干果的各个面都能受到微波的直接照射，大大提高了杀菌的均匀性和效率，同时，通过设置激振组件，使得连接板的晃动更加稳定和可控，进一步提高了杀菌效果。